Il arrive que les sites de mission active soient retirés pendant la maintenance du serveur, lorsque leur objectif de mission est indiqué comme terminé. Leur achèvement se produit souvent lorsque l'objet de mission requis devient disponible : nous vous conseillons donc de n'accepter et commencer une mission que lorsque vous pensez pouvoir la terminer et récupérer l'objet de mission avant le début de la maintenance quotidienne.
Si un site de mission est retiré alors que les objectifs de missions ne sont pas remplis, vous pouvez redéfinir le site de mission en vous amarrant puis appareillant depuis une station, ou en quittant puis entrant à nouveau dans un système. Vous devrez ensuite warper vers l'emplacement de la mission pour vérifier que le site est réapparu.
Tout joueur qui se trouve dans cette situation et n'est pas en mesure de faire réapparaître le site eux-mêmes en s'amarrant puis en appareillant peut envoyer un ticket au support client, en demandant à ce que la mission soit réinitialisée. Ces tickets doivent être envoyés dans la catégorie « Missions d'agent ». Toute réinitialisation effectuée recommencera totalement la mission. Les joueurs devront donc contacter leur agent à nouveau pour accepter la mission.