行星开发是一种从行星上提取原材料，将其用于制造在新伊甸中广泛使用的各种组件和商品的过程。如果玩家发现无法创建殖民地，可能是因为他们已经达到了殖民地上限。当玩家试图部署新的指挥中心时，系统就会显示“无法建造 - 已达殖民地数量上限”消息来提示玩家。
在这种情况下，玩家可以通过控制边栏“商业”菜单中的“行星殖民地”部分来查看自己当前的殖民地。如果玩家想要放弃已有的殖民地，他们无需前往殖民地所在的星系。
殖民地可以远程摧毁；你可以在“行星模式”中查看行星，然后点击指挥中心并选择“退役”。建立殖民地只是第一步，你还需要将材料从行星表面转运至太空中可到达的地方。
对于大多数玩家来说，材料都会被出口至轨道上的海关办公室。如果殖民地位于高安区域的行星上，则出口材料时需向海关办公室的所有者以及统合部缴纳税款。这将反映在玩家钱包出口费用的复式记账中。训练“海关操作专业理论”技能可以减少上缴给统合部的税金。
如果轨道上没有友方的海关办公室，那么当玩家尝试从发射平台发射材料时，则会显示相关提示。无可用海关办公室并不意味着玩家不能从地表取回材料。你可以发射储存在指挥中心里的材料。以这种方式发射的材料会装载在货柜中，可在太空中停留五天，此后货柜将完全降解并被移除。
这种行星地表发射最终会落在发射它们的行星附近；如果玩家不是本次发射的所有者，则不能直接跃迁到该处货柜。如果你是你本次发射的所有者，可通过日志中的“行星地表发射”标签来跃迁至该货柜。请注意，虽然阿尔法克隆可以对行星殖民地进行任何操作，但不能向殖民地进出口任何东西。