Каждый альянс может назначить одну систему столицей своего альянса, если у него есть Штаб владений в этой системе. Столицу можно перенести, но решение о переносе столицы вступит в силу через 7 дней после принятия. Коэффициент защиты столицы увеличивается на 2 (но в совокупности он не превышает установленного максимума, 6).
Если альянс утратил столицу, он может обычным образом определить новую столицу. Если альянс по тем или иным причинам удерживает суверенитет над в точности одной системой, эта система автоматически становится столицей альянса. Это исключение из правила о семидневном ожидании переноса столицы.