指挥脉冲波是一种力量增强装置，允许飞行员对脉冲波影响范围内的同一舰队中的舰船进行多方面的提升。启用后，指挥脉冲波会对舰船范围内同一舰队的所有成员提供加成，而脉冲波的效果范围即为有效范围。受指挥脉冲波影响的舰船会显示肉眼可见的特效，该效果会一直保留在舰船上，直到消失。
因此，战斗中无论是发射脉冲波还是被脉冲波影响的舰船，都非常容易辨认。指挥脉冲波的效果在一个星系中跃迁后依然有效，但在停靠、离站或切换星系时就会消失。驻留在建筑内的舰船不会获得指挥脉冲波的加成，即使它们处于有效范围之内。指挥脉冲波有5种不同的类型（装甲、护盾、信息战、游击战和采矿）。不同类型的脉冲波会提供不同的加成和持续时间。
一艘舰船可能会受到不同类型脉冲波的影响。但是，相同类型的脉冲波无法叠加，只有最强的一个才会生效。如果脉冲波影响的舰船属性同时受到舰船装备的加成，那么将受到堆叠惩罚。