Il peut arriver que le pilote automatique ne puisse pas préparer un itinéraire vers une destination sélectionnée dans l'espace connu, et qu'aucun système ne soit ajouté à la liste de système d'évitement (que vous pouvez voir en sélectionnant « Gérer l'itinéraire »). Dans beaucoup de cas, c'est le résultat d'une destruction de capsule qui s'est produite dans un ou plusieurs systèmes sur la route du système de destination, quand l'option « Éviter les systèmes où des décapsulages se sont produits » a été sélectionnée dans les paramètres de pilote automatique. Cela peut se défaire tout seul au bout d'un moment, mais si vous désélectionnez l'option, le pilote automatique pourra recréer un nouvel itinéraire.
Le pilote automatique ne pourra pas tracer une route vers une destination située dans un trou de ver.