为巩固对低安区域的管辖，新伊甸的四大帝国各自雇佣了国民卫队。国民卫队之间兵戎相见，分别与两大帝国结盟：盖伦特联邦和米玛塔尔共和国对战艾玛帝国和加达里合众国。
当帝国战火蔓延至各星系后，克隆飞行员投身各大阵营，塑造未来战争形态，赢取宝贵的忠诚点。
选择帝国势力
尚未加入阵营的克隆飞行员可点击控制边栏，打开势力战争菜单，然后选择加入一方帝国势力。四大帝国的国民卫队军团介绍如下：
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艾玛帝国：帝国圣战十字第二十四军团
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加达里合众国：合众国护卫军
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盖伦特联邦：联邦防务联合会
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米玛塔尔共和国：部族解放力量
个人克隆飞行员在确认要加入的势力后，只要势力声望不是负值，即可前往此势力成员军团的空间站，通过国民卫队办公室加入对应的国民卫队。在势力战争中，CEO可以自行注册整个军团，而联盟执行者却要以联盟名义注册。
个人飞行员可以随时加入或退出国民卫队，但军团和联盟需要等待数日，才能参与战争并代表效忠的帝国作战。如有实体加入势力战争，则敌对势力玩家有权攻击并摧毁入侵己方低安与高安区域的飞行员，不受统合部或炮台的干扰。同时，来犯飞行员也不会收到嫌犯计时器和罪犯计时器。
为帝国而战
战区控制标签会显示您加入的帝国及其敌对势力正在争夺的每个星系。点击地图上的某个星系可以显示其状态以及具有优势的一方，还会显示克隆飞行员为影响优势条而要完成的任务，最终为势力占领星系。势力战争中，不同星系的作战状况也不同，如下所述：
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前线：战争中心，毗邻敌方控制恒星系，授予飞行员最高级奖励。
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指挥部：战备要塞，毗邻前线星系，授予飞行员标准级忠诚点奖励。
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后卫：在激烈的势力战争中相对安全的区域，当以上状态不可用时适用。
处于势力战争中的星系的作战状态决定其属性，如特定星系效应、领地扩张、忠诚点(LP)奖励，以及帝国占领星系后可获得的胜利点数。例如，参加前线星系活动所获得的忠诚点奖励将增加50%！指挥部星系将提供标准级忠诚点奖励，以及比前线星系更安全的指挥部地点。
在势力战争窗口中点击争夺星系，右侧将显示优势跟踪条。为形成地形优势，跟踪条会列出克隆飞行员可以通过攻占前线和指挥部的毗邻星系、完成势力战争战区发布的活动并扩张领地，以及部署可锚定建筑实现的目标。所属势力在战区内的参战度越高，获胜次数越多，对胜利点数的影响就越大。根据星系类型，可实现目标将通过多方面影响星系。
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宣传屏：可部署建筑，能够破解传输频率，化解敌对势力的优势
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补给储藏室/支援：敌对势力的太空补给站，摧毁后即可化解敌对势力的优势
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集结点：易于攻破的NPC战斗群。消灭舰队指挥官后，将获得优势。
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作战中心：探索地点，蕴藏了部署宣传屏和监听哨站所需的重要代码。
势力战争奖励
克隆飞行员征战星系、扩张领地后，可获得由所属势力发放的忠诚点奖励，用以庆祝胜利。这些点数可以在忠诚点商店中兑换宝贵物品和蓝图。飞行员完成目标后获得的点数取决于星系的作战状态。
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前线星系奖励的忠诚点是生成忠诚点的1.5倍。
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指挥部星系奖励的忠诚点是生成忠诚点的1倍。
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后卫星系奖励的忠诚点是生成忠诚点的50%。
成功扩张领地后，舰队全员（最多5人）将获得忠诚点奖励，较个人飞行员而言高出25%，这也是帝国鼓励团结的一种手段。