战争可以解决争端，适用于有资格正式发动战争的玩家实体（玩家军团或联盟）。
宣战实体的所有成员均可自由对敌，统合部不会干预高安区域，而其他非法攻击也不会对安全等级造成任何损失。只要宣战方还能支付战争费用，或防守方或进攻方没有丧失参战资格，战争就不会结束。战争术语如下所示：
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进攻方：发起宣战的实体。
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防守方：接受宣战的实体。
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盟友：为防守方提供援助的玩家实体。
宣战和停战
无论有无理由，具有参战资格的玩家军团或联盟都能互相宣战。点击“战争”标签中的“宣战”，然后指定目标军团或联盟，即可在军团管理窗口中发起宣战。
必须指定战争总部才能发起宣战，而发动新战争则需要重新指定不同建筑作为战争总部。不能对没有参战资格的NPC军团或军团及联盟宣战。
全体参战方（及其股东）都能收到开战信号，24小时后，参战双方可选择任意地点对战。第一周的战争账单将在宣战时自动支付，而第二周的账单也会立即发布。为延续第一周的战争，有必要在截止日期前，手动支付第二周的账单。发生以下任一情况时，战争结束：
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进攻方未能及时支付每周战争账单。
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接受投降提议。
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进攻方或防守方失去战争资格，双边战争除外
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注意：战争总部拥有的结构加固期限为24小时，而其他建筑的结构加固期限为4.5天。
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停战时，所有参战方（及其股东）都将收到相关通知。
通知发布后，参战方的敌对状态还将持续24小时，随后统合部会再次干预高安区域。
投降
如有一方提出投降提议且征得另一方同意，则立即停战（冷却时间通常为24小时），且在2周（14天）内双方均不得再次宣战。这项保护措施可避免二次宣战，仅适用于一方投降的情况。如果不是因为投降而停战，则任意一方可随时再次宣战。
丢失战争总部
如果进攻方因任何原因丢失战斗总部，则基于此总部发起的战争也将结束。在这种情况下，进攻方将进入持续14天的休战期，期间不能基于丢失的总部发起任意战争。但在设立新总部后，进攻方就能随时向其他具有参战资格的实体宣战。
战争成本
在支付第一笔宣战费后，每周都要在截止日期前向统合部支付1亿星币，才能持续交战。为保持交战状态，每周都要在当前战争周期结束前支付这笔费用。
退出和加入参战军团或联盟
克隆飞行员可以随时退出交战中的军团，但要再等7天或等到停战才能重新回到军团。在战争中位于进攻方的军团在停战前无法加入联盟。位于防守方的军团不受此限制，因为在加入联盟的申请获批约24小时后，位于防守方的军团就能正式加入联盟，此时的战争等级也会升级为联盟战争。
由于交战时可以拷贝战争，所以往往会维持随时开战的状态，联盟领袖在接纳交战中的军团后，要及时通知联盟成员，以免在军团进入联盟后出现意外。位于防守方的军团成功加入联盟后，将立即与参战的盟友解除关系。作为参战联盟成员的军团可以随时退出联盟。
退出的军团可以拷贝所有正在进行的战争，并在当前付费周期内继续交战。如果进攻方在拷贝战争到期前续费，则可以继续交战。退出联盟的军团如果失去了参战资格，即使还能拷贝战争，也会像在交战期间失去参战资格一样，开始进入战争冷却时间。
提供战争援助
防守方可以在交战时寻求援助，接受结盟提议。这样一来，原本不相关的军团或联盟就能以有偿或无偿的方式代表防守方参战。结盟提议通过后，这些实体会在接下来两周的时间内加入防守方阵营，之后再重新商议结盟事宜。结盟提议不适合进攻方，想要与进攻方并肩作战的实体需要各自对防守方宣战。军团或联盟如果要向参战实体提出结盟提议，同样要具备参战资格。